6月4日上午，“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”第一届理事会第三次会议在中国科大理化大楼一楼科技展厅召开。中科院前沿科学与教育局陈晓峰副局长，中山大学原校长黄达人教授，中国科学院半导体所所长李树深院士、南京大学副校长潘毅教授、中科院上海技物所副所长戴宁研究员、中国科大郭光灿院士、潘建伟院士等五位理事会成员，国防科技大学科研部刘波副部长以及各协同单位相关职能部门负责人、协同创新中心代表参加了会议。理事会由协同创新中心理事长、中国科大侯建国校长主持。
侯校长说，“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”的组建得到了中科院和教育部的大力支持，今年三月，中心通过了严格的评审和现场考察，成为首批14家通过认定的协同创新中心之一，这是各协同单位共同努力的结果。目前，协同创新中心的工作已经到了实质性的建设阶段，希望能够在各位专家的指导下，尽快推动中心工作的快速稳步发展。
陈晓峰说，“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”很好地协同了中国科大、相关院所和兄弟高校等量子信息前沿科学领域的优势力量，中心的成立提供了科教结合的良好模板。近期，中科院成立了前沿科学与教育局，旨在将前沿科技的发展和教育的发展以及人才培养紧密结合起来，希望各协同单位能够在协同创新中心的建设过程中在科技创新与教育的结合方面多做开创性的探索，为中科院的科教融合工作提供一些经验。陈晓峰表示，中科院一定会为协同创新中心的发展创造良好的外部环境和条件。
理事会聘任黄达人教授为“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”战略咨询顾问。
协同创新中心主任潘建伟院士从中心的综合使命、主要研究方向和科技目标、学科发展目标、人才培养和团队建设目标、组建方式、组织结构、岗位设置、平台和基础设施、近期投入与支持计划以及将来的工作展望等方面，详细汇报了“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”发展规划编制情况。
会议审议并通过了由中心主任提名的六个研究部的主任和共同主任人选。
在随后的座谈讨论中，与会理事和顾问就协同创新中心的机制体制、组织架构、人才引进、学生培养、经费安排等方面进行了深入细致的讨论。
4日下午，“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”举行了第一次学术委员会会议。叶朝辉、朱邦芬、朱诗尧、孙昌璞、李树深、李家明、祝世宁、谢心澄、潘建伟等学术委员会委员和中心研究部主任参加会议。会议由学术委员会主任郭光灿院士主持。中心主任潘建伟院士向学术委员会汇报了中心的发展规划情况，中心研究部主任分别汇报了研究部的研究方向和团队建设计划。学术委员会就中心的学术方向、学科建设、团队建设、人才培养等方面的建设规划进行了讨论并提出了科学的建议。
为贯彻落实教育部、财政部“高等学校创新能力提升计划”（即“2011计划”），中国科学技术大学、南京大学、中国科学院上海技术物理研究所、中国科学院半导体研究所、国防科学技术大学联合培育组建了“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”。经过教育部组织的形式审查、专家初评、会议答辩、现场考察、综合咨询等评审认定过程，2013年4月11日，“量子信息与量子科技前沿协同创新中心”成为教育部公布的首批14家通过认定的协同创新中心之一。